Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDGFRAP16234 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms