Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RARBP10826 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RARBP10826 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RARBP10826 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms