Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
F13BP05160 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
F13BP05160 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
F13BP05160 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13BP05160 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13BP05160 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms