Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LDLRP01130 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LDLRP01130 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LDLRP01130 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LDLRP01130 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
LDLRP01130 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LDLRP01130 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LDLRP01130 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LDLRP01130 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LDLRP01130 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LDLRP01130 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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