Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN9O95484 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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