Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIN3BO75182 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms