Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CTDSP2O14595 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms