Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf172C9J069 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf172C9J069 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf172C9J069 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf172C9J069 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C9orf172C9J069 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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C9orf172C9J069 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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C9orf172C9J069 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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