Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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CFAP73A6NFT4 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CFAP73A6NFT4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CFAP73A6NFT4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CFAP73A6NFT4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CFAP73A6NFT4 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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