Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC138781.1-201ENST00000501322 505 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SSPOA2VEC9 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms