Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP15Q9Y4E8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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