Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFMBT1Q9UHJ3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms