Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms