Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDE1Q9NZC3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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