Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms