Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPIFA1Q9NP55 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPIFA1Q9NP55 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms