Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SMIM3Q9BZL3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SMIM3Q9BZL3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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