Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP58Q9BVL2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms