Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PMCHL2Q9BQD1 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms