Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms