Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RBBP8Q99708 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RBBP8Q99708 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms