Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSPG4P5Q96PW8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms