Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC114Q96M63 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC114Q96M63 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms