Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC97Q96F63 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms