Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMARCE1Q969G3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms