Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP13Q92995 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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USP13Q92995 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP13Q92995 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP13Q92995 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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