Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms