Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPC24Q8NBT2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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