Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF182Q8N6D2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms