Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LINC00299Q6ZSB3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms