Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LETMD1Q6P1Q0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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