Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FRMPD1Q5SYB0 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms