Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF2Q5BJF6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms