Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms