Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CSPP1Q1MSJ5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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