Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KNOP1Q1ED39 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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