Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRNQ16849 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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