Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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