Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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GABRA6Q16445 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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GABRA6Q16445 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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GABRA6Q16445 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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GABRA6Q16445 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GABRA6Q16445 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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