Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDCD2Q16342 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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