Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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