Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VPS72Q15906 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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VPS72Q15906 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VPS72Q15906 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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