Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
R3HDM1Q15032 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
R3HDM1Q15032 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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