Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FRMPD4Q14CM0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms