Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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