Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA9Q13797 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms