Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATP1A4Q13733 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATP1A4Q13733 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATP1A4Q13733 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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