Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms