Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms