| FOXE3 | Q13461 | PRPSAP2-216 | ENST00000536323 | 1872 nt | TSL 2 BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LRRC6-213 | ENST00000620350 | 1878 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FOLH1-202 | ENST00000340334 | 2697 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MLPH-203 | ENST00000409373 | 2031 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF208-205 | ENST00000601773 | 2027 nt | TSL 2 BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TARBP2-203 | ENST00000456234 | 1368 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL122018.1-201 | ENST00000446607 | 2310 nt | BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HTR7-202 | ENST00000336152 | 3126 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OBSL1-202 | ENST00000373873 | 3297 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FMNL1-206 | ENST00000587489 | 2487 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TNS2-201 | ENST00000314250 | 5010 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAP2K1-201 | ENST00000307102 | 3410 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.91 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | YY1AP1-201 | ENST00000295566 | 2626 nt | APPRIS P4 TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GREM1-202 | ENST00000560830 | 2648 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SPRY1-207 | ENST00000610581 | 2608 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LFNG-202 | ENST00000338732 | 1968 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC010247.2-201 | ENST00000559786 | 1955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF365-205 | ENST00000395254 | 4173 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | YPEL1-201 | ENST00000339468 | 4329 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NTMT1-204 | ENST00000372486 | 1487 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NKIRAS1-203 | ENST00000415901 | 1644 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRIM62-204 | ENST00000543586 | 1638 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CUL3-202 | ENST00000344951 | 6592 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FBXL19-204 | ENST00000471231 | 3641 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BRAP-201 | ENST00000327551 | 1947 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ETV5-206 | ENST00000434744 | 2213 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TOB1-202 | ENST00000499247 | 2229 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | COL6A2-202 | ENST00000310645 | 3446 nt | TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC245052.4-201 | ENST00000452097 | 4158 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CBY1-201 | ENST00000216029 | 1133 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ATP6V1F-201 | ENST00000249289 | 704 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CMA1-202 | ENST00000250378 | 937 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NFU1-201 | ENST00000303698 | 1034 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PQLC2L-201 | ENST00000312275 | 1201 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF18-201 | ENST00000322748 | 2767 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BRCC3-201 | ENST00000330045 | 2496 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C1orf43-205 | ENST00000368519 | 1163 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TUSC3-201 | ENST00000382020 | 3683 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LENEP-202 | ENST00000392487 | 555 nt | APPRIS P1 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TINF2-202 | ENST00000399423 | 2168 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | STMN1-203 | ENST00000399728 | 1712 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LSM5-207 | ENST00000410044 | 687 nt | TSL 3 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL583835.2-202 | ENST00000421363 | 1104 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RPS24-203 | ENST00000435275 | 656 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL731661.1-201 | ENST00000438217 | 758 nt | TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL049698.1-202 | ENST00000441716 | 757 nt | TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NOX5-203 | ENST00000448182 | 2498 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KRT223P-202 | ENST00000449164 | 1292 nt | BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF219-203 | ENST00000451119 | 2918 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CTBP2P5-201 | ENST00000454986 | 1264 nt | BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TMEM14B-204 | ENST00000461342 | 559 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RMDN1-212 | ENST00000519966 | 1164 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TCF7-218 | ENST00000520958 | 1408 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FOS-202 | ENST00000535987 | 1402 nt | TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AP000808.2-201 | ENST00000542410 | 569 nt | TSL 4 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KRT90P-201 | ENST00000549264 | 1064 nt | BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RN7SL48P-201 | ENST00000579283 | 293 nt | BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GNRHR2-203 | ENST00000581100 | 1187 nt | BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC010327.5-201 | ENST00000586923 | 3061 nt | BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC008805.2-201 | ENST00000590069 | 435 nt | TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TXNL4A-212 | ENST00000592957 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SNAP25-AS1-208 | ENST00000605592 | 556 nt | TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RPS24-214 | ENST00000613865 | 538 nt | TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HIST1H3I-201 | ENST00000616365 | 411 nt | APPRIS P1 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RAB34-222 | ENST00000625712 | 994 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | COX11-210 | ENST00000639671 | 696 nt | BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OSBPL10-201 | ENST00000396556 | 6600 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FAM149B1-201 | ENST00000242505 | 5408 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ELAVL2-201 | ENST00000223951 | 3763 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DDR1-271 | ENST00000513240 | 2882 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PRRT2-202 | ENST00000358758 | 2567 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC00552-201 | ENST00000625151 | 2579 nt | BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PTK7-210 | ENST00000471863 | 2412 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | THEMIS2-203 | ENST00000373925 | 1650 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC126365.1-201 | ENST00000578585 | 1514 nt | BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAP2K6-209 | ENST00000613873 | 1509 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC138894.1-201 | ENST00000635887 | 2824 nt | TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.5 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TTC29-208 | ENST00000513335 | 2226 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SOX7-201 | ENST00000304501 | 3216 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ARRDC4-201 | ENST00000268042 | 4072 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | VARS2-201 | ENST00000321897 | 4073 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC38A9-202 | ENST00000396865 | 2927 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | APBB1IP-202 | ENST00000376236 | 2771 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GRIK5-201 | ENST00000262895 | 3493 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAP7-207 | ENST00000616617 | 4326 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 11.9 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TMPRSS9-201 | ENST00000332578 | 3331 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ASAH1-221 | ENST00000636128 | 1608 nt | TSL 5 BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GPSM3-207 | ENST00000375043 | 1456 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF451-201 | ENST00000357489 | 4998 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC00910-206 | ENST00000592135 | 2438 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KCNQ4-201 | ENST00000347132 | 4099 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GHRLOS-201 | ENST00000439539 | 1708 nt | TSL 1 (best) BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LYSMD4-204 | ENST00000409796 | 2672 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HNRNPH1-201 | ENST00000329433 | 2114 nt | TSL 2 BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PPL-205 | ENST00000590782 | 5845 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRIM41-201 | ENST00000315073 | 3637 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FLI1-207 | ENST00000534087 | 3859 nt | TSL 2 BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC18A1-203 | ENST00000381608 | 1419 nt | TSL 5 BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DCUN1D4-203 | ENST00000451288 | 4269 nt | TSL 2 BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ELAC1-201 | ENST00000269466 | 2235 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 11.89 | □□□□□ -0.51 | | |